Matriisin kemiallisia ominaisuuksia ovat pääasiassa pH-arvo, johtavuusarvo, kationinvaihtokyky, ravinteet ja veden laatu.
pH-arvo: Matriisin pH-arvo vaikuttaa ravinteiden muotoon, liukoisuuteen ja tehokkuuteen. Tuotannossa matriisin happamuuden ja emäksisyyden edellytetään olevan suhteellisen vakaa. Yleisesti ottaen matriisin pH-arvon tulisi olla 5,5-7,5. pH-arvo on liuoksen vetyionipitoisuuden asteikko ja liuoksen happamuuden ja alkaliteetin mitta.
Johtavuusarvo: heijastaa matriisissa alun perin kuljetetun liukoisen suolan määrää, joka vaikuttaa suoraan ravinneliuoksen tasapainoon ja kasvin kasvuun. Yleensä matriisin liukoisen suolan pitoisuus ei saisi ylittää 1000 mg/kg, edullisesti pienempi tai yhtä suuri kuin 500 mg/kg.
Kationinvaihtokyky: Kationinvaihtokapasiteetti (CEC-arvo) ilmaistaan 1000 grammalla matriisia korvattujen kationien sentimoolien lukumääränä. Yleensä 10–100 senttimoolia/kg on sopivampi. Kationinvaihtokyky on tärkeä indikaattori arvioitaessa matriisin kykyä pidättää ja vapauttaa ravinteita.
Ravinteet ja veden laatu: Veden laatua arvioidaan pääasiassa emäksisyyden, liukoisten suolojen (tai johtavuuden) ja veden ravinteiden perusteella. Yleensä liukoisten suolojen kerääntyminen veteen, substraatteihin ja lannoitteisiin estää juurien kehittymisen ja aiheuttaa juurimätä.